3D Slicer

avec Julien Finet à Lyon, France

19 Mars 2018 (Durée: 1 jour)

3DSlicer est une application dédiée à la visualisation et à l'analyse de données volumiques. Basée sur des bibliothèques libres et elle-même sous licence BSD, elle offre une interface intuitive donnant accès à des algorithmes de traitements d'image évolués. 3DSlicer est conçue comme une plate-forme de développement adaptée aux projets de recherche gravitant autour d'applications en imagerie. Cet outil est aujourd'hui utilisé dans une multitude de projets, de l'imagerie médicale (cérébrale, chirurgie assistée, IRMf) à l'astronomie en passant par la paléontologie.

Cette formation s'adresse aux utilisateurs d'outils de visualisation scientifique, mais aussi aux développeurs désireux d'apporter une personnalisation souvent indispensable à une application spécifique.

Objectifs

  1. Comprendre l'interface de 3DSlicer

  2. Charger/Sauvegarder des données (DICOM, modèles surfaciques,...)

  3. Ecrire des scripts Python

  4. Utiliser des algorithmes de segmentations et de recalage


Prérequis

  1. Connaissances de base en imagerie (volume, traitements)

Programme

Comprendre l'interface de 3DSlicer

  • Eléments habituels de visualisation scientifique ou d'imagerie médicale
  • Séquences d'interactions originales

Charger/Sauvegarder des données (DICOM, modèles surfaciques,...)

  • Diversité des formats supportés
  • Charger, visualiser, sauvegarde, exporter

Utiliser des algorithmes de segmentation et de recalage

  • Segmentation manuelle et semi automatique
  • Algorithmes de traitement d'image avancés
  • Croissance de région
  • Recalage manuel et semi automatique

Ecrire des scripts python

  • Modifier l'interface dans un environnement de programmation simplifié
  • Développer ses propres fonctionnalités et les intégrer dans l'interface
  • Traitement d'images avec NumPy

 

Cette formation sera donnée en anglais sauf si tous les participants maîtrisent la langue française.
Pour cette formation, chaque participant doit venir avec son ordinateur portable.
Les spécificités d'installation seront communiquées en amont par l'instructeur.

Les supports de cours sont en anglais.
Le repas du midi est inclus.

Les formations Kitware peuvent être personnalisées et dispensées selon vos besoins aux centres de formation Kitware (En Europe: Lyon, France; ou aux USA: Clifton Park, New York; Carrboro, North Carolina; Santa Fe, New Mexico) ou dans votre entreprise (demande de devis).

Voir les autres formations
* Une réduction de 10% (soit 432 € HT) est appliquée pour les étudiants.

Informations pratiques

19 Mars 2018
(Fin des inscriptions anticipées: 26 Février 2018)

Tarif de référence: 600 €
Tarif de la session: 480 € HT*

S'inscrire Contactez nous

A propos du formateur

Julien Finet a obtenu un D.U.T. en informatique spécialisé en Traitement d'image à l'Institut Universitaire de Reims suivi du diplôme d'ingénieur en informatique de l'Université de Technologie de Compiègne (UTC).

Avant de rejoindre Kitware en 2008, M. Finet a effectué un stage dans le département d'Imagerie Neuronale chez Siemens Corporate Research à Princeton, NJ aux Etats-Unis. Il a ensuite travaillé en tant que consultant pour General Electric Healthcare à Buc dans le département de l'Advantage Workstation.

 A Kitware, Julien Finet a été impliqué dans de nombreux projets d'imagerie médicale et de visualisation scientifique (VTKITKParaview...). Il a notamment été responsable technique pour porter 3D Slicer à Qt. Il a de plus été un des principaux développeurs sur CTK et a aussi dirigé le projet Bender, une application basée sur Slicer qui permet de repositionner des modèles anatomiques. En 2014, Julien a rejoint l’équipe européenne à Lyon en France.

©2018 Kitware SAS. 26 rue Louis Guérin 69100 Villeurbanne, France, +33 (0)4 37 45 04 15